MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 44489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	AT	3	6	30	35	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010830	AATA	2	8	41	48	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010830	ATT	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010830	AAT	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010830	A	6	6	171	176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010830	CTT	2	6	194	199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010830	TA	3	6	268	273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010830	TAG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010830	ACA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010830	ATT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010830	GTT	2	6	402	407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010830	T	6	6	466	471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010830	AAT	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010830	AATT	2	8	529	536	50 %	50 %	0 %	0 %	189501471
15	NC_010830	AAC	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501471
16	NC_010830	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	189501471
17	NC_010830	T	7	7	660	666	0 %	100 %	0 %	0 %	189501471
18	NC_010830	AGA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501471
19	NC_010830	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
20	NC_010830	TAA	2	6	709	714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501471
21	NC_010830	TAT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
22	NC_010830	ATA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501471
23	NC_010830	CA	3	6	862	867	50 %	0 %	0 %	50 %	189501471
24	NC_010830	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501471
25	NC_010830	CTG	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501471
26	NC_010830	CAA	2	6	1007	1012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501471
27	NC_010830	TGT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501471
28	NC_010830	CTT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501471
29	NC_010830	AC	3	6	1191	1196	50 %	0 %	0 %	50 %	189501471
30	NC_010830	TTTA	2	8	1198	1205	25 %	75 %	0 %	0 %	189501471
31	NC_010830	GAT	2	6	1227	1232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
32	NC_010830	TAG	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
33	NC_010830	A	6	6	1255	1260	100 %	0 %	0 %	0 %	189501471
34	NC_010830	T	6	6	1272	1277	0 %	100 %	0 %	0 %	189501471
35	NC_010830	CAAA	2	8	1307	1314	75 %	0 %	0 %	25 %	189501471
36	NC_010830	TGA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
37	NC_010830	CAC	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501471
38	NC_010830	AAGA	2	8	1360	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	189501471
39	NC_010830	CT	3	6	1371	1376	0 %	50 %	0 %	50 %	189501471
40	NC_010830	GCA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501471
41	NC_010830	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
42	NC_010830	TAG	2	6	1486	1491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
43	NC_010830	AT	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	189501471
44	NC_010830	ATT	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
45	NC_010830	TGG	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501471
46	NC_010830	GAT	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
47	NC_010830	GAA	2	6	1899	1904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501471
48	NC_010830	AAAAG	2	10	1908	1917	80 %	0 %	20 %	0 %	189501471
49	NC_010830	TAA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010830	AAT	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010830	AGT	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010830	AT	3	6	2006	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010830	AAAT	2	8	2021	2028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010830	AAAT	2	8	2107	2114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010830	ATATA	2	10	2169	2178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010830	CAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010830	ATCT	2	8	2189	2196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010830	TGC	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010830	CAA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010830	ACA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010830	C	6	6	2325	2330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_010830	ATT	2	6	2391	2396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010830	T	7	7	2395	2401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010830	AT	5	10	2462	2471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010830	ACCA	2	8	2474	2481	50 %	0 %	0 %	50 %	189501472
66	NC_010830	ATT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501472
67	NC_010830	T	6	6	2511	2516	0 %	100 %	0 %	0 %	189501472
68	NC_010830	TAATCT	2	12	2518	2529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501472
69	NC_010830	TTAGTT	2	12	2539	2550	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189501472
70	NC_010830	GAAT	2	8	2582	2589	50 %	25 %	25 %	0 %	189501472
71	NC_010830	TAA	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501472
72	NC_010830	A	7	7	2607	2613	100 %	0 %	0 %	0 %	189501472
73	NC_010830	T	6	6	2642	2647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010830	A	6	6	2762	2767	100 %	0 %	0 %	0 %	189501473
75	NC_010830	CATTG	2	10	2807	2816	20 %	40 %	20 %	20 %	189501473
76	NC_010830	CTT	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501473
77	NC_010830	CAA	2	6	2948	2953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501473
78	NC_010830	AAGT	2	8	2988	2995	50 %	25 %	25 %	0 %	189501473
79	NC_010830	ACT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501473
80	NC_010830	AGG	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501473
81	NC_010830	CTT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010830	TA	3	6	3211	3216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010830	AT	3	6	3243	3248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010830	CAG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010830	AC	3	6	3351	3356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010830	ATG	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010830	TAA	2	6	3398	3403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010830	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010830	AT	3	6	3415	3420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010830	TAA	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010830	AAT	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010830	ATA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010830	GCA	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501474
94	NC_010830	AGT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501474
95	NC_010830	ACCA	2	8	3610	3617	50 %	0 %	0 %	50 %	189501474
96	NC_010830	TTGGA	2	10	3644	3653	20 %	40 %	40 %	0 %	189501474
97	NC_010830	TAC	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501474
98	NC_010830	TAAAGA	2	12	3793	3804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189501474
99	NC_010830	TAAAA	2	10	3820	3829	80 %	20 %	0 %	0 %	189501474
100	NC_010830	TGT	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501474
101	NC_010830	TGG	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501474
102	NC_010830	TA	3	6	3914	3919	50 %	50 %	0 %	0 %	189501474
103	NC_010830	CTAACA	2	12	3998	4009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189501474
104	NC_010830	TATT	2	8	4105	4112	25 %	75 %	0 %	0 %	189501474
105	NC_010830	ATA	2	6	4127	4132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501474
106	NC_010830	GTT	2	6	4192	4197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501474
107	NC_010830	AGCT	2	8	4225	4232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010830	TAA	2	6	4238	4243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010830	TAACCA	2	12	4463	4474	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010830	TAAA	2	8	4496	4503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010830	GTA	2	6	4530	4535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010830	TTA	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010830	ACT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010830	TAA	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010830	TACC	2	8	4600	4607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010830	AAG	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010830	TAT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010830	TTA	2	6	4673	4678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010830	AGC	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010830	ACAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	0 %	25 %	189501475
121	NC_010830	ATT	2	6	4758	4763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501475
122	NC_010830	GT	3	6	4787	4792	0 %	50 %	50 %	0 %	189501475
123	NC_010830	GTT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501475
124	NC_010830	AGC	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
125	NC_010830	A	8	8	4866	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	189501475
126	NC_010830	TGG	2	6	4961	4966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501475
127	NC_010830	GCA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
128	NC_010830	ACT	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
129	NC_010830	GCT	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501475
130	NC_010830	AGC	2	6	5014	5019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
131	NC_010830	AAAAG	2	10	5024	5033	80 %	0 %	20 %	0 %	189501475
132	NC_010830	ATTAG	2	10	5037	5046	40 %	40 %	20 %	0 %	189501475
133	NC_010830	TCC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189501475
134	NC_010830	TAC	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
135	NC_010830	AGT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501475
136	NC_010830	TTAC	2	8	5246	5253	25 %	50 %	0 %	25 %	189501475
137	NC_010830	TAC	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
138	NC_010830	A	7	7	5455	5461	100 %	0 %	0 %	0 %	189501475
139	NC_010830	TA	3	6	5487	5492	50 %	50 %	0 %	0 %	189501475
140	NC_010830	TTA	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501475
141	NC_010830	T	6	6	5607	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	189501475
142	NC_010830	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	189501475
143	NC_010830	T	6	6	5726	5731	0 %	100 %	0 %	0 %	189501475
144	NC_010830	AT	3	6	5854	5859	50 %	50 %	0 %	0 %	189501475
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162	NC_010830	GAC	2	6	6674	6679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_010830	CAT	2	6	7766	7771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_010830	TA	3	6	8063	8068	50 %	50 %	0 %	0 %	189501476
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279	NC_010830	T	6	6	11343	11348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_010830	TA	3	6	11424	11429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_010830	AT	3	6	17475	17480	50 %	50 %	0 %	0 %	189501482
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